您的理解有誤。首先，乙公司確實(shí)獲得了存貨，并因此支付了120*13%的增值稅，但這部分增值稅是可以作為進(jìn)項(xiàng)稅額抵扣的，所以并不是乙公司的實(shí)際損失。其次，甲公司以120萬元（含稅價(jià)為120*1.13萬元）的存貨抵償了200萬元的債務(wù)，因此乙公司的實(shí)際損失是200萬元減去獲得的存貨的含稅價(jià)值，即200-120*1.13=64.4萬元。這就是乙公司的債務(wù)重組損失。

對于甲公司而言，其以低于債務(wù)價(jià)值的存貨抵債，獲得了債務(wù)重組收益，同時(shí)其銷售存貨也獲得了資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓收益。所以甲公司的債務(wù)重組收益是200萬元減去存貨的含稅價(jià)值，即64.4萬元，資產(chǎn)轉(zhuǎn)讓收益是存貨的市場價(jià)值120萬元減去賬面成本100萬元，即20萬元。甲公司的總收益是這兩部分之和，應(yīng)納的企業(yè)所得稅也是以這個(gè)總收益為基礎(chǔ)計(jì)算的。

關(guān)于增值稅的問題，增值稅雖然是價(jià)外稅，但是在債務(wù)重組中，存貨的含稅價(jià)值是抵償債務(wù)的實(shí)際價(jià)值，所以在計(jì)算債務(wù)重組損失和收益時(shí)需要考慮增值稅。