區(qū)別主要如下：

原理：進料加工業(yè)務，國外購進的料件是保稅進口的，即沒有支付過進項稅額，但是國內(nèi)購進的輔料是支付過進項稅額的，因此可以退稅，因為出口退稅中的退，退的是進項稅額。

來料加工業(yè)務，受托方只是提供加工勞務，該來源于國外的料件，完全是委托方提供的，自己并沒有支付過進項稅額，所以不存在退稅，其雖然也會有耗用國內(nèi)購進輔料的情形，但是這部分進項稅額也是不準退稅的，原因是國家不鼓勵來料加工業(yè)務，因為該業(yè)務本身就是一個加工廠的行為業(yè)務，跟進料加工不同，進料加工是自負盈虧，買材料，利潤空間比較大，而來料加工相對利潤空間較少，這樣會導致我們國家本身收上來的稅也不多，所以不給予退稅。簡單記憶就是，進料加工，免稅并退稅；來料加工，免稅不退稅。

宏觀比較：

（1）含義不同：

來料加工，是境外企業(yè)提供原材料，境內(nèi)企業(yè)只提供加工勞務，收取加工費，產(chǎn)成品要交給境外企業(yè)。

進料加工，境內(nèi)企業(yè)自己進口，自己生產(chǎn)，自己出口銷售。

（2）增值稅處理不同：

來料加工：①進、出口免稅；②加工費免稅；③一般不涉及退稅問題。

進料加工：①進、出口免稅；②出口免稅同時進口料件不退稅,但是從國內(nèi)購進的料件退稅（采取免稅并退稅辦法）。

（3）關稅處理不同：

來料加工：進、出口免稅。

進料加工：復出口免稅。

（4）對于相關輔料的處理不同：

來料加工：輔料不得抵扣進項。（視同銷售免稅貨物，所以耗用的境內(nèi)購進材料的進項不能抵扣）。

進料加工：輔料可以抵扣進項。（視同銷售自產(chǎn)貨物，出口適用零稅率，可以抵扣購進材料的進項稅）。