1、行為對象不同。行政確認(rèn)是指對行政相對人既有法律地位、權(quán)利義務(wù)的確定和認(rèn)可，主要是指對身份、能力和事實(shí)的確認(rèn);行政許可的行為對象是許可行政相對人獲得為某種行為的權(quán)利或資格。一般來說，前者是業(yè)已存在，而后者是許可之前不得為之。

2、行為的法律效果不同。行政確認(rèn)中未被認(rèn)可的行為或地位將發(fā)生無效的結(jié)果而不適用法律制裁;而在行政許可中，未經(jīng)許可而從事的行為將發(fā)生違法后果，當(dāng)事人將因此受到法律制裁。即前者的法律效果具有前溯性，對今后僅是一種預(yù)決作用;而后者的法律效果具有后及性，不具有前溯性。

3、所為的意思不同。行政確認(rèn)行為表明行政主體的態(tài)度是對某種狀態(tài)、事件、物或行為予以法律上的承認(rèn)、確定或否定;而行政許可行為則是行政主體在對申請人的申請進(jìn)行審查和判斷的前提下，對申請是否予以準(zhǔn)許或同意的行為。

4、行為性質(zhì)不同。行政確認(rèn)屬于確認(rèn)性或宣示性行政行為，它僅表明現(xiàn)有的狀態(tài)，而不以法律關(guān)系的產(chǎn)生、變更或消滅為目的。行政許可，從其正常狀態(tài)(即批準(zhǔn))而言是建立、改變或者消滅具體的法律關(guān)系，是一種形成性行政行為。

5、內(nèi)容不同。行政確認(rèn)行為的內(nèi)容具有“中立性”，它并不直接為當(dāng)事人設(shè)定權(quán)利或義務(wù)，對當(dāng)事人是有利還是不利，取決于確認(rèn)時(shí)原已存在的法律狀態(tài)或事實(shí)狀態(tài);而行政許可行為則是一種授益性行政行為，它直接為申請人授益。

(一)適用范圍不同：行政審批的適用范圍較寬，可以歸入行政審批的項(xiàng)目種類按照目前的統(tǒng)計(jì)不下于50種，甚至包括推薦、命名、備、證明等。而根據(jù)《行政許可法》第二條的規(guī)定，行政許可大體上可以分為五類。

(二)設(shè)定的條件不同。行政許可是一項(xiàng)重要的行政權(quán)力?！缎姓S可法》規(guī)定：只有法律、行政法規(guī)和國務(wù)院有普遍約束力的決定可以設(shè)定行政許可，地方性法規(guī)可以依據(jù)法定條件設(shè)定行政許可，地方政府規(guī)章可以依據(jù)法定條件設(shè)定臨時(shí)性行政許可。其他規(guī)范性文件一律不得設(shè)定行政許可。

而行政審批事項(xiàng)的設(shè)定，法律并無嚴(yán)格限制，各級行政機(jī)關(guān)(也包括非行政機(jī)關(guān))都可以設(shè)定審批事項(xiàng)。

下列事項(xiàng)可以設(shè)定行政許可：

(一)直接涉及國家安全、公共安全、經(jīng)濟(jì)宏觀調(diào)控、生態(tài)環(huán)境保護(hù)以及直接關(guān)系人身健康、生命財(cái)產(chǎn)安全等特定活動(dòng)，需要按照法定條件予以批準(zhǔn)的事項(xiàng)；

(二)有限自然資源開發(fā)利用、公共資源配置以及直接關(guān)系公共利益的特定行業(yè)的市場準(zhǔn)入等，需要賦予特定權(quán)利的事項(xiàng)；

(三)提供公眾服務(wù)并且直接關(guān)系公共利益的職業(yè)、行業(yè)，需要確定具備特殊信譽(yù)、特殊條件或者特殊技能等資格、資質(zhì)的事項(xiàng)；

(四)直接關(guān)系公共安全、人身健康、生命財(cái)產(chǎn)安全的重要設(shè)備、設(shè)施、產(chǎn)品、物品，需要按照技術(shù)標(biāo)準(zhǔn)、技術(shù)規(guī)范，通過檢驗(yàn)、檢測、檢疫等方式進(jìn)行審定的事項(xiàng)；

(五)企業(yè)或者其他組織的設(shè)立等，需要確定主體資格的事項(xiàng)；

(六)法律、行政法規(guī)規(guī)定可以設(shè)定行政許可的其他事項(xiàng)。

申請人除以傳統(tǒng)方式向行政機(jī)關(guān)遞交申請書以外，還可以利用現(xiàn)代的通訊手段提出申請。申請人可以向具備接收條件的行政機(jī)關(guān)，通過電報(bào)、電傳、傳真、電子數(shù)據(jù)交換和電子郵件等方式提交申請。通過上述方式提出申請，主要適用于只需要申請人提交有關(guān)書面材料，不用提交實(shí)物、樣品的行政許可。行政許可法作出這一規(guī)定，目的在于鼓勵(lì)行政機(jī)關(guān)和申請人利用現(xiàn)代科技，提高行政效能，同時(shí)也體現(xiàn)了行政許可的便民原則。以上述方式提交的申請具有與普通申請書相同的效力。鑒于通過電子數(shù)據(jù)交換、電子郵件方式提出行政許可申請，在一些地方還是新鮮事物，在具體操作程序上還有待完善，因此行政許可法只作了倡導(dǎo)性的規(guī)定。

實(shí)施行政許可應(yīng)當(dāng)遵循法定原則；公開、公平、公正原則；便民和效率原則；救濟(jì)原則；信賴保護(hù)原則；行政許可不得轉(zhuǎn)讓原則；監(jiān)督原則。

行政許可事項(xiàng)是指行政機(jī)關(guān)及法律、法規(guī)授權(quán)的具有管理公共事務(wù)職能的組織根據(jù)公民、法人或者其他組織的申請，經(jīng)依法審查，準(zhǔn)予其從事特定活動(dòng)的事項(xiàng)。

行政登記分為行政許可登記、行政確認(rèn)登記和其他行政登記，行政登記的范圍大于行政許可登記的范圍。行政登記是指行政機(jī)關(guān)為實(shí)現(xiàn)一定的行政管理目的，根據(jù)法律、法規(guī)、規(guī)章的有關(guān)規(guī)定，依相對人申請，對符合法定條件的涉及相對人人身權(quán)、財(cái)產(chǎn)權(quán)等方面的法律事實(shí)予以書面記載的行為。

行政確認(rèn)行為與行政審批行為緊密聯(lián)系：行政審批與行政確認(rèn)常常是同一行政行為的兩個(gè)步驟，一般是確認(rèn)在前，審批在后，確認(rèn)是審批的前提，審批是確認(rèn)的結(jié)果。