1、行為對象不同。行政確認是指對行政相對人既有法律地位、權(quán)利義務(wù)的確定和認可，主要是指對身份、能力和事實的確認;行政許可的行為對象是許可行政相對人獲得為某種行為的權(quán)利或資格。一般來說，前者是業(yè)已存在，而后者是許可之前不得為之。

2、行為的法律效果不同。行政確認中未被認可的行為或地位將發(fā)生無效的結(jié)果而不適用法律制裁;而在行政許可中，未經(jīng)許可而從事的行為將發(fā)生違法后果，當(dāng)事人將因此受到法律制裁。即前者的法律效果具有前溯性，對今后僅是一種預(yù)決作用;而后者的法律效果具有后及性，不具有前溯性。

3、所為的意思不同。行政確認行為表明行政主體的態(tài)度是對某種狀態(tài)、事件、物或行為予以法律上的承認、確定或否定;而行政許可行為則是行政主體在對申請人的申請進行審查和判斷的前提下，對申請是否予以準許或同意的行為。

4、行為性質(zhì)不同。行政確認屬于確認性或宣示性行政行為，它僅表明現(xiàn)有的狀態(tài)，而不以法律關(guān)系的產(chǎn)生、變更或消滅為目的。行政許可，從其正常狀態(tài)(即批準)而言是建立、改變或者消滅具體的法律關(guān)系，是一種形成性行政行為。

5、內(nèi)容不同。行政確認行為的內(nèi)容具有“中立性”，它并不直接為當(dāng)事人設(shè)定權(quán)利或義務(wù)，對當(dāng)事人是有利還是不利，取決于確認時原已存在的法律狀態(tài)或事實狀態(tài);而行政許可行為則是一種授益性行政行為，它直接為申請人授益。

下列事項可以設(shè)定行政許可：

(一)直接涉及國家安全、公共安全、經(jīng)濟宏觀調(diào)控、生態(tài)環(huán)境保護以及直接關(guān)系人身健康、生命財產(chǎn)安全等特定活動，需要按照法定條件予以批準的事項；

(二)有限自然資源開發(fā)利用、公共資源配置以及直接關(guān)系公共利益的特定行業(yè)的市場準入等，需要賦予特定權(quán)利的事項；

(三)提供公眾服務(wù)并且直接關(guān)系公共利益的職業(yè)、行業(yè)，需要確定具備特殊信譽、特殊條件或者特殊技能等資格、資質(zhì)的事項；

(四)直接關(guān)系公共安全、人身健康、生命財產(chǎn)安全的重要設(shè)備、設(shè)施、產(chǎn)品、物品，需要按照技術(shù)標準、技術(shù)規(guī)范，通過檢驗、檢測、檢疫等方式進行審定的事項；

(五)企業(yè)或者其他組織的設(shè)立等，需要確定主體資格的事項；

(六)法律、行政法規(guī)規(guī)定可以設(shè)定行政許可的其他事項。

稅務(wù)行政許可有4項。指定企業(yè)印制發(fā)票；對發(fā)票使用和管理的審批（包括申請使用經(jīng)營地發(fā)票和印制有本單位名稱的發(fā)票）；對增值稅防偽稅控系統(tǒng)最高開票限額的審批；印花稅票代售許可。

稅務(wù)行政許可的實施機關(guān):

(一)稅務(wù)行政許可由具有行政許可權(quán)的稅務(wù)機關(guān)在法定權(quán)限內(nèi)實施，各級稅務(wù)機關(guān)下屬的事業(yè)單位一律不得實施行政許可。

稅務(wù)機關(guān)是指各級稅務(wù)局、稅務(wù)分局、稅務(wù)所以及省以下稅務(wù)局的稽查局。稅務(wù)機關(guān)是否具有行政許可權(quán)，由設(shè)定稅務(wù)行政許可的文件確定。

(二)沒有法律、法規(guī)、規(guī)章的規(guī)定，稅務(wù)機關(guān)不得委托其他機關(guān)實施行政許可。

(三)各級稅務(wù)機關(guān)應(yīng)當(dāng)指定一個內(nèi)設(shè)機構(gòu)或者設(shè)置固定窗口，統(tǒng)一負責(zé)受理行政許可申請、送達行政許可決定。

稅務(wù)行政許可具有以下特征：

行政許可決定書是指在經(jīng)過審查程序后，便進入決定程序。申請人提交的申請材料齊全、符合法定形式，行政機關(guān)能夠當(dāng)場作出決定的，應(yīng)當(dāng)當(dāng)場作出書面的行政許可決定。

申請人除以傳統(tǒng)方式向行政機關(guān)遞交申請書以外，還可以利用現(xiàn)代的通訊手段提出申請。申請人可以向具備接收條件的行政機關(guān)，通過電報、電傳、傳真、電子數(shù)據(jù)交換和電子郵件等方式提交申請。通過上述方式提出申請，主要適用于只需要申請人提交有關(guān)書面材料，不用提交實物、樣品的行政許可。行政許可法作出這一規(guī)定，目的在于鼓勵行政機關(guān)和申請人利用現(xiàn)代科技，提高行政效能，同時也體現(xiàn)了行政許可的便民原則。以上述方式提交的申請具有與普通申請書相同的效力。鑒于通過電子數(shù)據(jù)交換、電子郵件方式提出行政許可申請，在一些地方還是新鮮事物，在具體操作程序上還有待完善，因此行政許可法只作了倡導(dǎo)性的規(guī)定。

行政許可與行政審批的區(qū)別：

行為對象不同。行政審批的行為對象是審批行政相對人獲得為某種行為的權(quán)利或資格，主要是作為性的行為;行政確認則是指對行政相對人既有法律地位和權(quán)利義務(wù)的確定和認可，主要是指身份、能力和事實的確認等等。

行政確認行為與行政審批行為緊密聯(lián)系：行政審批與行政確認常常是同一行政行為的兩個步驟，一般是確認在前，審批在后，確認是審批的前提，審批是確認的結(jié)果。

1、行政機關(guān)實施行政許可，原則上不得收費

行政收費是指一定的行政機關(guān)憑借國家行政權(quán)所確立的地位，為個人和組織提供一定的公益服務(wù)，或授予其國家資源和資金的使用權(quán)而收取的費用。

2、行政機關(guān)實施行政許可收費，必須有法律、行政法規(guī)作依據(jù)

行政機關(guān)實施行政許可收取費用，必須有法律、行政法規(guī)作為依據(jù)。我國現(xiàn)行有關(guān)法律、行政法規(guī)對實施行政許可收取費用作了規(guī)定，如進出口商品檢驗法第三十條規(guī)定，商檢機構(gòu)和其他檢驗機構(gòu)依照本法實施檢驗和辦理鑒定業(yè)務(wù)，依照規(guī)定收費。

3、行政機關(guān)提供行政許可申請格式文本，不得收費

為防止行政機關(guān)借提供申請書格式文本之際收取不正當(dāng)?shù)馁M用或者變相收費，行政許可法專門規(guī)定，提供格式文本不得收取費用。